Микробиологическое исследование тонкой кишки (микробиота)
Микроэкологический статус — это исследование основано на определении специфических веществ, которые микробы содержат в своей клеточной стенке или выделяют в процессе своей жизнедеятельности.
Если патогенная микрофлора преобладает, начинаются проблемы с иммунитетом, нервной системой, пищеварением, снижается аппетит, ухудшаются память и концентрация внимания, развиваются различные заболевания.
Анализ крови на микробиоту заключается в выявлении микробных маркеров, которые могут говорить о наличии в организме воспалительных, инфекционных и других заболеваний.
Анализ микробиоты способом ГХ-МС «Сухая капля»
Чтобы узнать состояние вашей микробиоты, мы предлагаем сдать кровь методом ГХ-МС – лабораторный анализ оценки биоматериала при помощи газовой хроматографии и масс-спектрометрии. Основан метод на выявлении ДНК микроорганизмов с оценкой их соотношения и численности. По результатам этого анализа определяется наличие в организме разных видов бактерий и определяется их воздействие на организм пациента.
Анализ микробиоты помогает поставить верный диагноз и выявить действительную причину проблем пациента, а также в дальнейшем осуществлять мониторинг его состояния, контроль и корректировку лечения.
Анализ микробиоты методом ГХ-МС — является как самостоятельный анализ, так и дополнение к традиционным методам обследования.
Назначать исследование микробиоты могут специалисты разных направлений медицины: хирурги, гастроэнтерологи, урологи, гинекологи, дерматологи.
Описание исследования микробиоты методом ГХ-МС
Анализ крови позволяет оценить состояние микробного баланса организма в целом, а также обнаружить наличие воспалительных процессов разной локализации. С помощью метода ГХ-МС одновременно и напрямую с высокой точностью определяются десятки разных групп микроорганизмов в организме человека: бактерий, грибов и вирусов.
Сегодня данное исследование по капли крови позволяет получить подробную информацию о количестве и составе микроорганизмов в биотопе тонкого кишечника.
Наиболее актуальные из них:
- Нормофлора – Lactobacillus spp, Bifidobacterium sppи т.д.
- Грамотрицательные бактерии — Gram(-)
- Анаэробные бактерии – Clostridium spp, Staphylococcus spp и т.д.
- Грибы и вирусы – Candida spp, Herpes simplex и т.д.
- Плазмалоген и эндотоксин.
Когда нужно сдавать анализ на микробиоту
- Дисбактериоз.
- Длительный прием антибиотиков.
- Подозрение на нарушение микрофлоры.
- Синдром раздраженного кишечника.
- Частые запоры или диарея.
- Язвенный колит.
- Избыточное газообразование.
- Болезнь Крона — хроническое воспалительное заболевание кишечника.
- Планирование беременности.
- Нарушения стула (после COVID-19).
- Туберкулез, пневмония, бронхит, плеврит.
- Различные ЛОР-заболевания: отит, гайморит и другие.
- Различные высыпания на лице, коже спины, груди.
- Синдром хронической усталости.
- Аутоиммунные заболевания.
- Сахарный диабет.
- Аллергия.
- Избыточный вес.
- Избыточные силовые нагрузки.
- Долгий стресс.
Данный анализ играет огромную роль при лечении таких заболеваний как:
- Заболевания кожного покрова.
- Заболевания пищеварительной системы.
- Хронические воспалительные процессы.
- Непереносимость продуктов.
Исследования микробиоценозов методом ГХ-МС применяются для оценки репродуктивного статуса, при терапии бесплодия или других серьезных патологий половой сферы у мужчин и женщин.
Преимущество исследования ГХ-МС
- Газовая хромато-масс-спектрометрия является точным и высокочувствительным методом анализа.
- Методика уникальна в том плане, что выявляет даже «спящих» возбудителей болезни.
- В рамках одного анализа выявляются различные виды микроорганизмов, которые могут являться участниками воспалительных процессов:
одновременно определяются 58 родов и видов аэробных и анаэробных бактерий, грибов и вирусов (анаэробы — бактерии, которые живут и размножаются в бескислородной среде).
В настоящее время всё больше и больше научных исследований приводят к выводам, что причины более 90% всех известных болезней человека кроется в больном кишечнике.
Подготовка к исследованию
- Кровь следует сдавать утром, натощак.
- За 24 до анализа следует исключить алкоголь и воздержаться от интенсивных физических нагрузок.
- За 8 часов до взятия крови не следует есть, а также пить только негазированную воду.
- Накануне взятия анализа лучше поужинать лёгкой, нежирной пищей.
- За 3–4 часа до анализа не курить, избегать стресса и физического напряжения.
- Лекарства (например, антибиотики, пробиотики, метабиотики и антидепрессанты) и медицинские процедуры могут повлиять на результат анализа.
- Не следует сдавать кровь сразу после физиотерапевтических процедур, инструментального обследования, рентгенологического и ультразвукового исследований, массажа.
- Лучше всего выполнять исследование крови до начала приёма лекарственных препаратов или через 10–14 дней после их отмены. О принимаемых в данный момент лекарствах следует предупредить медсестру, а также врача, который выполняет диагностику или назначает лечение.
- Достоверность исследования напрямую зависит от следования данным рекомендациям.
Противопоказания и ограничения
Абсолютных противопоказаний нет.
Об отчет анализа
В отчете наглядно представлены возможные избытки и дефициты показателей.
Дополнительно показаны удобные таблицы сгруппированных важных микроорганизмов.
Как читать анализ на микробиоту
Разбор базового анализа для оценки состояния тонкого кишечника.
Часть 1
- Бланк лабораторного исследования
Перед вами бланк лабораторного исследования, в котором представлены данные о 58 микроорганизмах. Именно так выглядит первая страница результатов оценки тонкого кишечника методом газовой хромато-масс-спектрометрии (ГХ-МС).
В таблице:
- Резидентные микроорганизмы
Пункты с 1 по 28 (или по 27 в детских бланках) — это резидентные микроорганизмы, те, которые проживают в нашем кишечнике на постоянной основе. У каждого микроорганизма есть своя функция, они представляют основу микробиоты, благотворно влияющей на жизнедеятельность человека. Но ровно до того момента, пока находятся в балансе.
- Транзиторные микроорганизмы
Транзиторные микроорганизмы — это представители микробных сообществ, в норме практически не встречающиеся. Они являются условно-патогенными, их постоянное присутствие нехарактерно для здорового человека. Такие микроорганизмы могут вызывать воспалительный процесс, отражать паразитарную активность.
- Микроскопические грибы
Как же много хлопот доставляют грибы и инфекции, порожденные ими. Но, увы, бороться с ними не так уж просто. Прием антимикотиков и фармпрепаратов не всегда может увенчаться успехом. Ведь при работе с грибами в первую очередь нужно уничтожать биопленки.
- Вирусы
Все три вируса в бланке относятся к герпесвирусным инфекциям.
Вирус простого герпеса представлен 2 типами.
1 тип вызывает назолабиальный герпес — всем знакомая простуда на губах.
Герпес 2 типа провоцирует генитальный герпес.
Вирус Эпштейна-Барр — это вирус герпеса 4 типа, связанный с аутоиммунными заболеваниями. Он вызывает инфекционный мононуклеоз у детей и синдром хронической усталости у взрослых.
Цитомегаловирус — это вирус герпеса 5 типа.
Симптоматика: повышение температуры тела, больное горло, увеличенные лимфоузлы. Часто протекает без осложнений, а иногда и бессимптомно. Цитомегаловирус связан с колитом, эзофагитом, неврологическими расстройствами. Выраженная вирусная нагрузка опасна, ведь помимо риска развития заболеваний, она несет высокую онкологическую настороженность.
- Голубой и розовый
При внушительном увеличении количества того или иного микроорганизма, его окошко выделяется розовым цветом, а дефицит окрашивается голубым. Таким образом, просто бросив взгляд на бланк, можно увидеть картину избыточного или дефицитного состояния по тому или иному микроорганизму.
- Плазмалоген
В нижней части бланка указаны два показателя, выделенные жирным, которые крайне важны для детального анализа кишечной микробиоты.
Начнем с плазмалогена. Это жировая молекула, которая вырабатывается представителями нормобиоты: лакто-, бифидо-, эу-, пропионобактериями.
Плазмалоген участвует в обмене жирных кислот, регулирует высвобождение холестерина, оказывает благотворное влияние на организм в целом и является показателем нормальной жизнедеятельности бактерий. Оптимальным принято считать значение от 35 до 50 мкг/мл. Если показатель находится в оптимальном значении, значит нормобиота в достаточном количестве и выполняет все свои функции.
- Эндотоксин
Следующий показатель — эндотоксин. Это вещество, находящееся в стенке бактерии и являющееся фактором ее патогенности. Когда стенки клеток разрушаются, фрагменты наружной мембраны высвобождаются, включая эндотоксины. Их чрезмерная выработка стимулирует развитие местной воспалительной реакции, с повреждением внутренней стенки кишечника и нарушением кишечного барьера. Именно поэтому так важно обращать внимание на его уровень, который должен быть не более 0.3 наномоль/мл, хотя на бланке вы видите референс до 0.5.
Часть 2
- Соотношение результатов по сгруппированным микроорганизмам
Самая первая строка таблицы — это резидентные микроорганизмы, которые проживают в нашем кишечнике на постоянной основе: бифидо-, лакто-, эу-, пропионобактерии, стафилококки, стрептококки и другие представители микробиоты. Их дефицит или, напротив, избыток свидетельствует о повреждении слизистого слоя кишечника.
Когда бактериальная нагрузка выше нормы, мы констатируем синдром избыточного бактериального роста — СИБР. А это всегда воспаление.
Следующая строка — транзиторная микробиота. Это случайные гости, которые вот-вот должны покинуть организм. Их количество составляет около одной тысячной % или даже меньше. Если же мы видим выраженное увеличение показателя, то можно полагать наличие той или иной патологии.
Далее мы видим графу «в норме не встречаются», которая, к счастью, почти всегда остается пустой.
Строка “микроскопические грибы” дает нам представление об общей нагрузке грибов. Увеличение данной нагрузки говорит о синдроме избыточного грибкового роста — СИГР.
Аэробные бактерии — микроорганизмы, которые растут и развиваются при условии доступа кислорода.
Анаэробы — их братья антагонисты, которым кислород не требуется от слова совсем. Они отлично себя ощущают в бескислородной среде. По мере того, как мы спускаемся от ротовой полости в пищевод, желудок и дальше — количество аэробов будет снижается, а анаэробов — увеличиваться.
Также нам важно знать отличие грамположительных и грамотрицательных бактерий. В микробиологии существует окраска по Граму — это основной, но не единственный метод окраски для исследования микроорганизмов. Если микроорганизм не имеет определенной структуры в своей клеточной стенке, то он окрашивается красителем в фиолетовый цвет и называется грамположительным. Если же микроорганизм, будучи окрашенным, выглядит бледно-розовым, значит его клеточная стенка защищена определенной структурой, которая не способна вбирать в себя краситель. Такой микроорганизм является грамотрицательным. Вспомните любую аннотацию к антибактериальным средствам: «имеет выраженное действие против грам-бактерий». Теперь вы понимаете, о чем идет речь.
- Экспресс-таблица нормофлоры.
Таблица помогает оценить ядро микробиоты — тех самых полезных микроорганизмов нашего кишечника.
- Экспресс-таблица грамотрицательных бактерий.
Таблица грамотрицательных микроорганизмов нужна для оценки токсической нагрузки, которую данные микроорганизмы могут создавать.
Часто задаваемые вопросы?
Что такое метод ГХ-МС? ГХ-МС (расшифровывается как газовая хромато-масс-спектрометрия) – метод, который основан на двух методах: газовой хроматография и масс-спектрометрия. ГХ-МС помогает оценить состояние микрофлоры тонкого кишечника.
Данный метод представляет новое направление в микробиологии, а именно диагностике инфекций и воспалений по маркерам (микробные химические вещества). Они содержатся в микроорганизмах или формируются ими. Принцип диагностики по маркерам состоит в том, что они существенно отличаются по строению от клеток человека. К примеру, у человека жирных кислот больше 20 видов, а у микробов порядка 200, поэтому выявить наличие микробов в организме человека не составляет особого труда.
Микробиота — совокупность микроорганизмов, которые населяют кожу и слизистые оболочки желудочно-кишечного тракта, полостей носа и рта, органов мочеполовой системы.
Самой многочисленной считается микробиота кишечника — на неё приходится около 60% всех бактерий, колонизирующих тело человека.
Состояние и состав микробиоты влияют практически на все процессы, происходящие в кишечнике – всасывание питательных веществ, инактивацию токсинов и так далее. Также микроорганизмы могут продуцировать пептиды или белки, которые проникают в кровь и влияют, например, на аппетит человека.
Полезные (комменсальные) бактерии помогают иммунной системе справиться с болезнетворными микроорганизмами, в некоторых случаях подавляют воспалительные и аллергические реакции.
Основные виды полезных бактерий-комменсалов:
• лактобактерии,
• бифидобактерии,
• кишечные палочки (типичные).
Условно патогенные (оппортунистические) бактерии обычно безвредны для здоровых людей и в небольшом количестве присутствуют в организме для поддержания разнообразия микрофлоры. Но если баланс кишечной микробиоты нарушается, например, из-за сбоя в работе иммунной системы, то такие бактерии быстро размножаются и могут причинить вред.
Виды условно патогенных микроорганизмов:
• энтеробактерии (эшерихии, бактерии рода протей, клебсиеллы): могут вызвать инфекционные заболевания желудочно-кишечного тракта, лёгких, мочеполовой системы, печени, желчевыводящих путей;
• неферментирующие грамотрицательные бактерии (псевдомонады, нейссерии, легионеллы): вызывают заболевания мочевыводящих путей и органов репродуктивной системы, кишечника, а также пневмонии, менингиты, отиты;
• грамположительные кокки (стафилококки, стрептококки, энтерококки) и анаэробные бактерии: возбудители гнойно-воспалительных заболеваний;
• грибы: провоцируют инфекции органов желудочно-кишечного тракта.
Одна из основных функций микробиоты — синтез короткоцепочечных жирных кислот (КЦЖК), основного источника энергии для клеток слизистой оболочки кишечника. Также КЦЖК защищают организм от патогенов и токсинов, обладают противоопухолевым и противовоспалительным эффектом, стимулируют развитие нормальной микрофлоры, регулируют кислотно-щелочной баланс и поддерживают усвоение калия, магния, хлора, натрия и воды.
Другие функции микробиоты кишечника:
• выведение из организма отработанных биологически активных веществ, в том числе ферментов;
• выработка гормонов, мочевой кислоты, незаменимых аминокислот и нейропептидов — биологически активных соединений, которые участвуют в обмене веществ.
Изучение микробиоты продолжается. Появились исследования, в которых доказана взаимосвязь между нарушением микрофлоры кишечника и сахарным диабетом второго типа, ожирением, сердечно-сосудистыми заболеваниями.
Есть данные о взаимодействии кишечной микробиоты и нервной системы: микробиота производит нейроактивные молекулы — ацетилхолин, серотонин, дофамин — главные медиаторы сигналов в центральной нервной системе. Если состав микробиоты нарушается, то заболевания центральной нервной системы могут прогрессировать.
В желудке, двенадцатиперстной и прямой кишке есть белки-рецепторы к вирусу SARS-CoV-2. Вирус связывается с рецепторами и проникает в клетки. При этом в слизистой оболочке кишечника может развиться воспаление, на фоне которого часто возникают гастроэнтерологические симптомы: диарея, синдром мальабсорбции — нарушение усвоения питательных веществ, дисбактериоз — состояние, при котором страдает микрофлора кишечника.
Нарушение микробиоты сохраняется и в постковидном периоде. Примерно у 6% переболевших дисбактериоз сопровождается расстройствами дефекации (опорожнение прямой кишки).
Анализ проводится с использованием газовой хроматографии-масс-спектрометрии (ГХ-МС) на оборудовании «Agilent Technologies» (США). В основе метода лежит определение микроорганизмов по так называемым «микробным маркерам» — жирным кислотам, которые производятся бактериями в процессе жизнедеятельности.
